Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap4s1Q9WVL1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap4s1Q9WVL1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms