Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn8aQ9WTU3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms