Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6cQ9WTM3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms