Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spo11Q9WTK8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spo11Q9WTK8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms