Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psma4Q9R1P0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psma4Q9R1P0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms