Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Col4a3Q9QZS0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col4a3Q9QZS0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col4a3Q9QZS0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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