Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phtf1Q9QZ09 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phtf1Q9QZ09 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms