Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cul3Q9JLV5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cul3Q9JLV5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms