Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gde1Q9JL56 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gde1Q9JL56 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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