Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot9Q9JKY0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms