Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nectin1Q9JKF6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nectin1Q9JKF6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms