Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 289.5 ms