Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClpxQ9JHS4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpxQ9JHS4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpxQ9JHS4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpxQ9JHS4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpxQ9JHS4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpxQ9JHS4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpxQ9JHS4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClpxQ9JHS4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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