Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms