Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SENP3Q9H4L4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms