Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn12Q9ET43 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn12Q9ET43 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn12Q9ET43 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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