Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trim39Q9ESN2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trim39Q9ESN2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim39Q9ESN2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms