Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp29Q9ES63 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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