Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrnb2Q9ERK7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrnb2Q9ERK7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms