Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms