Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl4Q9DCU6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms