Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtr1Q9DBC3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtr1Q9DBC3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms