Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tysnd1Q9DBA6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tysnd1Q9DBA6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms