Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med29Q9DB91 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med29Q9DB91 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms