Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5oQ9DB20 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms