Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cab39lQ9DB16 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cab39lQ9DB16 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cab39lQ9DB16 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cab39lQ9DB16 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cab39lQ9DB16 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cab39lQ9DB16 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cab39lQ9DB16 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cab39lQ9DB16 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39lQ9DB16 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms