Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms