Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnot8Q9D8X5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms