Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U2af1Q9D883 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms