Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa5Q9D7I0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Shisa5Q9D7I0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms