Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfn4Q9D6I3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfn4Q9D6I3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfn4Q9D6I3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfn4Q9D6I3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pfn4Q9D6I3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfn4Q9D6I3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms