Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
4930449I24RikQ9D5E3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930449I24RikQ9D5E3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms