Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sf3a3Q9D554 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3a3Q9D554 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms