Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms