Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf128Q9D304 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf128Q9D304 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms