Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms