Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mrpl28Q9D1B9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mrpl28Q9D1B9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mrpl28Q9D1B9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl28Q9D1B9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Mrpl28Q9D1B9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Mrpl28Q9D1B9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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