Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms