Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mms19Q9D071 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mms19Q9D071 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms