Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU6

Cs, Citrate synthase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsQ9CZU6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CsQ9CZU6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CsQ9CZU6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms