Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp11Q9CZJ1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp11Q9CZJ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms