Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot11Q9CWN7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot11Q9CWN7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms