Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Atxn3Q9CVD2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Atxn3Q9CVD2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Atxn3Q9CVD2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Atxn3Q9CVD2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Atxn3Q9CVD2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atxn3Q9CVD2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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Atxn3Q9CVD2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atxn3Q9CVD2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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