Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930519P11RikQ9CUJ8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms