Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp13a2Q9CTG6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms