Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CR55 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CR55 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CR55 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CR55 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CR55 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CR55 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CR55 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CR55 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CR55 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CR55 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms