Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otub2Q9CQX0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otub2Q9CQX0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms