Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NepnQ9CQ76 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NepnQ9CQ76 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms