Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
StambpQ9CQ26 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StambpQ9CQ26 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms