Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Chmp3Q9CQ10 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Chmp3Q9CQ10 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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